Tháng 3/1998, địa điểm 241 Cầu Giấy không đáp ứng đủ nhu cầu do số lượng bệnh nhân ngày càng đông, Trung tâm chuyển về địa điểm 44 Phố Hàng Quạt, Trung tâm được đầu tư thêm 6 tỷ VNĐ, trở thành một trong những phòng khám đa khoa tư nhân lớn nhất Hà nội với 14 chuyên khoa. 
Ngày 19/9/2001 UBND Thành phố Hà nội ra Quyết định số 77/2001/TC-CQ cho phép thành lập Bệnh viện Đa khoa Tràng An. Công ty Y học đã đầu tư thêm hơn 10 tỷ VNĐ để cải tạo nâng cấp mua sắm thêm trang thiết bị hiện đại phát triển Trung tâm KCB và ứng dụng công nghệ y học cao tại 44 Hàng Quạt thành Bệnh viện đa khoa Tràng An, với 21 giường bệnh nội trú, 10 khoa, 14 chuyên khoa. 
Ngày 07/07/2003, UBND Thành phố Hà nội ra quyết định số 3904/QĐ-UB cho phép Bệnh viện đa khoa Tràng An chuyển về địa điểm 59 Thông Phong – Tôn Đức Thắng – Đống Đa – Hà Nội. Tổng diện tích mặt sàn sử dụng: 3.258m2 gồm: 
01 nhà 5 tầng 
01 nhà 2 tầng 
01 nhà 1 tầng 
Công ty Phát triển Công nghệ Y học đã đầu tư thêm hơn 33 tỷ VNĐ mua sắm trang thiết bị y tế hiện đại, cải tạo các công trình kiến trúc, bảo vệ môi trường xây dựng hệ thống nâng cấp thành Bệnh viện có 60 giường nội trú. 
Đội ngũ cán bộ công nhân viên 
1. Cán bộ sau đại học: 
- Phó giáo sự, Giáo sư: 06 người 
- Tiến sỹ y học : 08 người 
- Thạc sỹ: 06 người 
- Bác sỹ chuyên khoa cấp II: 17 người 
- Bác sỹ chuyên khoa cấp I: 10 người 
2. Cán bộ Đại học: 
- Bác sỹ: 20 người 
- Dược sỹ: 02 người 
- Các bộ đại học khác: 10 người 
3. Cán bộ Trung học: 
- Y sỹ: 10 người 
- Điều dưỡng viên: 17 người 
- Y tá: 15 người 
- Kỹ thuật viên: 21 người 
- Dược sỹ Trung học: 02 người 
- Dược tá: 02 ngưới 
- Cán bộ cao đẳng khác: 06 người 
- Cán bộ trung học khác: 10 người 
- Cán bộ nhân viên khác: 20 người